Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms