Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PRAMEF10O60809 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PRAMEF10O60809 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PRAMEF10O60809 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PRAMEF10O60809 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PRAMEF10O60809 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF10O60809 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PRAMEF10O60809 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PRAMEF10O60809 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PRAMEF10O60809 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PRAMEF10O60809 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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