Protein–RNA interactions for Protein: O60671

RAD1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD1O60671 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD1O60671 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD1O60671 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD1O60671 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD1O60671 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD1O60671 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD1O60671 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD1O60671 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD1O60671 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD1O60671 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD1O60671 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD1O60671 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD1O60671 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD1O60671 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD1O60671 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD1O60671 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD1O60671 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD1O60671 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD1O60671 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD1O60671 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms