Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CXCL13O43927 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CXCL13O43927 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CXCL13O43927 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CXCL13O43927 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CXCL13O43927 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CXCL13O43927 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CXCL13O43927 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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