Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD6O43541 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms