Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC7A4O43246 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms