Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms