Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBDO15205 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBDO15205 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBDO15205 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBDO15205 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBDO15205 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBDO15205 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBDO15205 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
UBDO15205 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBDO15205 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBDO15205 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBDO15205 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBDO15205 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBDO15205 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBDO15205 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBDO15205 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBDO15205 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UBDO15205 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBDO15205 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms