Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZBTB39O15060 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBTB39O15060 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms