Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM6BO15054 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6BO15054 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms