Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EBAG9O00559 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms