Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC01387J3KSC0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms