Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms