Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RGPD3A6NKT7 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms