Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRIT2A6NDA9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms