Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAF6Q9Y4K3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TRAF6Q9Y4K3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TRAF6Q9Y4K3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TRAF6Q9Y4K3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TRAF6Q9Y4K3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF6Q9Y4K3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TRAF6Q9Y4K3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TRAF6Q9Y4K3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TRAF6Q9Y4K3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TRAF6Q9Y4K3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TRAF6Q9Y4K3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TRAF6Q9Y4K3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF6Q9Y4K3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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