Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SH3BP1Q9Y3L3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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