Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9Y3F1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9Y3F1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.2 ms