Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NINLQ9Y2I6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NINLQ9Y2I6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NINLQ9Y2I6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NINLQ9Y2I6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NINLQ9Y2I6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NINLQ9Y2I6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NINLQ9Y2I6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NINLQ9Y2I6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NINLQ9Y2I6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NINLQ9Y2I6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NINLQ9Y2I6 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms