Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9BQ9UPX0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.6 ms