Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF346Q9UL40 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms