Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP25Q9UHP3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP25Q9UHP3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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