Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms