Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
REREQ9P2R6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REREQ9P2R6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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