Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms