Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC180Q9P1Z9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC180Q9P1Z9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms