Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms