Protein–RNA interactions for Protein: Q9C040

TRIM2, Tripartite motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM2Q9C040 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM2Q9C040 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM2Q9C040 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms