Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms