Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms