Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MGME1Q9BQP7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MGME1Q9BQP7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms