Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS8Q99627 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms