Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SORT1Q99523 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms