Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RPS6KC1Q96S38 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS6KC1Q96S38 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms