Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms