Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP4Q96P64 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGAP4Q96P64 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms