Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms