Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPNS2Q96L46 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPNS2Q96L46 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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