Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
C18orf8Q96DM3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C18orf8Q96DM3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms