Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A6Q92581 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms