Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms