Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C17orf47Q8NEP4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms