Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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ZNF548Q8NEK5 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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ZNF548Q8NEK5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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ZNF548Q8NEK5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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ZNF548Q8NEK5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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ZNF548Q8NEK5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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