Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF248Q8NDW4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF248Q8NDW4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF248Q8NDW4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF248Q8NDW4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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