Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 282.9 ms