Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP5

MFSD9, Major facilitator superfamily domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD9Q8NBP5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MFSD9Q8NBP5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms