Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AVL9Q8NBF6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms