Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms