Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms