Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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FAM71DQ8N9W8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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FAM71DQ8N9W8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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FAM71DQ8N9W8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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FAM71DQ8N9W8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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FAM71DQ8N9W8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FAM71DQ8N9W8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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FAM71DQ8N9W8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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FAM71DQ8N9W8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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FAM71DQ8N9W8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM71DQ8N9W8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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